常出现先天畸形和遗传性疾病。例如表兄妹结婚，痴呆儿发生率比非近亲结婚高150倍，新生儿死亡率和畸形率也比非近亲结婚高3倍多。而近亲结婚者的女在20岁前死亡率达13。9%，非近亲结婚却仅为1。7%。
在古埃及，由于长期的近亲结婚，很多法老也都患有遗传病。譬如说那位著名的少年法老图坦卡蒙，就是一位疾病缠身的少年，有着畸形足和颚裂，需要拐杖的帮助才可以行走——考古学家在他的坟墓发现了100多根拐杖，显然是为图坦卡蒙的来生而准备的。
根据上述的科学研究结果，近亲结婚不利于孙后代的健康成长，这绝对是一条确证无疑的公理。
但从另一个角度来看，古代人类的寿命原本就十分短暂，婴儿的夭折率通常就超过一半，而成年人在天灾、瘟疫和战争之的死亡率和残疾率也相当高。一直到工业革命前夕，当时号称最明最先进的欧洲人，平均寿命依然没有超过40岁，而在遥远的古埃及时代，埃及人的平均寿命和生活质量就更加悲催了。
在这里可以举一个反例，曾经一度风俗放荡的古罗马帝国，在公元三世纪全民皈依了基督教之后，开始严格执行一夫一妻制度，禁止各种背德****的陋习，奉行廉洁节制的生活态度。按道理来说，这样婴儿的存活率应该会变得比较高了吧！可事实上，根据东罗马帝国政府在七世纪对首都君士坦丁堡市民家庭的一次统计普查，当时全城婴儿出生的存活率只有60%，其很大一部分还会在三岁之前夭折。
因此，在古埃及时代，婴儿患遗传病的几率变高一些，似乎还称不上什么严重问题，因为原本的夭折比率就已经过半了。事实上，那些患有严重遗传病的孩，通常根本就没有机会长大成人。而埃及法老在身体力行的“广种薄收”之下，一般来说总还是会繁育出几个健康婴儿的，不必过分担忧继承人的问题。
此外还可以做一个类比：根据某部外国小说的内容，一位年轻的士兵在前线战地被一位漂亮的****百般****，虽然士兵十分心动，却又担心她身上有艾滋病。于是****就非常老道地“教导”这个菜鸟说：作为一个很可能在明天就会被弹打死的人，你又何必为某种在十年之后才会威胁生命的疾病而发愁呢？
同样的道理，如果某位穿越者来到了古埃及，并且成为了王或法老的话，那么他尽可以放心大胆地推倒自己的姐姐和妹妹，而无须去顾忌当时还不存在的某些伦理道德，以及跟瘟疫、战争和天灾相比而言根本无足轻重的遗传病——前提是只要你能够过得了自己心里的那道坎……
但是，作为一个负责任的人，我觉得在这里还是有必要提醒大家一下：从来也没有哪位神明规定过，法老的女儿就一定会是貌若天仙、温柔可人的大美女，而不是歪瓜裂枣、弯腰驼背、瘸腿瞎眼的丑姑娘……至于脾气暴躁、天生放荡的泼妇，或者阴险毒辣、手段残忍的恶女，在王室里就更是多得数不胜数了。
如果亲生姐妹的数量很多，法老或许还可以从里面挑出一个比较意的人选，立为自己的王后。但如果这一代的埃及公主只有一两个，而且品行容貌全都不怎么样，那么法老的婚事就会比较难办了。
然而，碍于神圣的近亲结婚律法，法老们还是不得不硬着头皮与这些未必很美好的亲生姐妹结婚——只要稍微回忆一下，埃及艳后的前后两任弟弟丈夫是什么下场（一个被姐姐的姘头凯撒击败战死，一个直接被艳后毒杀），你应该就不会对“娶个姐姐当老婆”这种禁忌的婚姻，抱有太多美好的幻想了。
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