李嗣兴对此极力镇压，在杀掉了几个闹的最凶的军官后，才安定下来。这时永历又来安慰这些降职的军官，许愿将来在战场上，每个立功者都有封侯拜将的机会。听到皇帝的许愿，不甘心的军官们内心才平静，暗自鼓劲准备多立战功。
经过这次整编，加强了明军的协调指挥系统，提高了战斗力。后来随着明军的发展壮大，后又在团的基础上加设了师，和临时的集团军编制。（后世的各**队都是参照大明的军队编制设置的）
改编完军队，安定了军心，永历皇帝开始琢磨，怎样才能从清军的眼皮子低下潜入到清廷的腹地哪？
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