，吹奏起了笛子，随着‘呜~呜~呜~~呜~呜呜呜——’的笛声的不断传播，七根翡翠般的石柱也随着韵律和音符而发光，绿色的泉水不断的涌出，从祭坛向下流去，泉水向大海远处扩散，绿色的开始晕染，大海完全染成了发光的绿色。
“啾啾啾~~”，而就在这时，火焰鸟、闪电鸟和急冻鸟也随之复原了，围绕在四周飞舞，，乌云散去，天空开始慢慢放晴，明媚的阳光照耀着大地，覆盖的冰雪慢慢消融，绿光散尽后大海终于又呈现了蓝色，展现了它的广博。
“太好了”，看到一切都恢复了，小霞非常高兴的说道，小智也一脸微笑的看着这个世界，这个自己亲手拯救的世界。
“上来吧”，洛奇亚看到世界复原后，俯下身对小智说道。
“好”，而小智则是非常高兴的攀上洛奇亚的背，皮丘也跳上了小智的肩膀，而后洛奇亚就带着小智飞上了大海上空，小智俯瞰着下方的大海非常的兴奋，虽然刚才也经历过，不过那是毕竟是要带回冰之宝物，没有时间欣赏，而且这时洛奇亚的身后从海里带出一股海流，在空中前进，非常壮观，火焰鸟、闪电鸟和急冻鸟也飞在一旁，之前来橘子群岛的神奇宝贝们也要各自回自己的故乡了，现在是真正的天海交融了。
飞行了一段时间后，海流回落于大海中了，火焰鸟、闪电鸟和急冻鸟也各自飞回了自己的岛屿，洛奇亚则是把小智送到了祭坛所在的岛上，芙萝拉这时也停止了吹奏，祭坛也恢复了原样。
“就把我当成传说中的存在吧，对于这个世界来说也是一种幸福”，事情都圆满的结束了，时间也到了傍晚，红色的夕阳映照着大家，大海也被染成了红色，洛奇亚此时也要离开了，他通过心灵感应对大家说道。
“嗯，不过期待与你的再次相见”，小智也知道该结束的迟早也结束的，所以就回答说，随后洛奇亚就潜入了水中，离开了。
“它走了”，小霞走过来，靠着小智说道。
“是啊”，小智也有点颇为怀念的说，不过说不定会再见呢。
“小智，小智——”，这时一旁有人在呼喊小智。
“妈妈”，原来是小智的妈妈他们终于从祭坛后的山上爬了下来，小智看着急切的跑过来的妈妈，非常的尴尬，虽然知道是自己在这个世界的妈妈，可是在自己来到这里的第一天，就出来旅行了，关东大赛开始之前和结束之后有一段时间在家里，可是自己忙着训练也没有和妈妈真正的呆在一起过，小智是真的不知道要怎么面对。
“小智，我看到了，为什么做这么危险的事”，小智的妈妈气喘吁吁的跑过来就非常生气的问小智说。
“可是，小智拯救了这个世界”，小霞则是在一旁替小智说话，希望缓解一下气氛。
“那又怎么样，你还是小孩子，不能乱来啊；拯救世界，赌上性命去做？小智不在的话，就没有小智的世界了，就没有我的儿子了，因为有你，所以才有世界”，小智的妈妈花子说着说着语气就弱了下来，眼中开始出现泪水。
“妈妈”，听了妈妈的话，小智的眼眶也湿润了，不得不说小智是一个感性的人，那句‘因为有你，所以才有世界’成功的戳中了小智的泪点，“妈妈”，小智扑进了妈妈的怀里哭了起来，哭的非常伤心，谁说男儿有泪不轻弹，只是未到伤心处，独自来到这个世界，旅行中认识了小霞、小刚、小建还有其他的朋友，收获了许多重要的伙伴，不过还是在夜深的时候会有孤独的感觉，仿佛自己是处于这个世界之外的一样，小智现在好像是把这么长时间的压抑、苦闷、孤独、寂寞全都发泄了出来，因为他又有了血肉至亲——他的妈妈，这一刻，小智终于完全的融入了这个世界，花子是他永远的妈妈。
“好了，别哭了”，抱着小智一会儿之后，大木博士和内木博士终于干了过来，小智的妈妈对小智说道。
“嗯”，小智离开妈妈的怀抱，擦干泪水，露出了幸福的笑容。
“好，快点来研究这件事吧，返回真新镇了”，大木博士刚到这里后就急着要回去研究了，而后就跑开了，小智的妈妈因为是同一班机，所以也只好跟着走了，小智本来还想要和妈妈多聊一会儿呢，不过现在没有机会了。
让我们再来看一下其他人的情况吧，收藏家的飞行物彻底的毁坏了，只好离开了，不知道是建造新的飞行物去了，还是有了新的目标，反正是不知所踪了，也许在未来的某个地方会再次相遇；而火箭队在放开洛奇亚的时候，本来以为会摔落于冰面上而死亡，不过迎接他们的却是被神奇宝贝们破开冰层的大海，因此得救了，在事情终于圆满结束的时候，他们也爬上了祭坛所在的岛屿，不过已经找不到小智他们了，不过相信很快就会相见的，呵呵。
又解决了一件事，不过小智他们也再次踏上了旅行，最后一个徽章正在等待着他。
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