为萧智担心教导旅一旦扩编，其战斗力会下降。
现在要北伐了，萧智希望教导旅和台湾师能做为北伐的先锋，充分挥其强悍的战斗力，为北伐赢得第一战的胜利。至于两个的部队的防务工作，萧智的计划是：由新组建的第十三师配合岛内剩余的两个团防卫台湾，由新组建的第十二师驻守四国，以新组建的第十师和第十一师再配合地方守备旅及预备役师来防守安南省的本土，6军第一师至第九师再加上教导旅和台湾师共十个又一个旅参加北伐，总兵力约16万人，同时，太平洋海军以及印度洋海军中登6舰艇均参加北伐。萧智相信，凭借这些部队是可以控制住江南地区，只要不出现什么意外，六个月内完全可以在长江以南站住脚跟的。
海军在北伐中的作用被萧智总结成了三句话：运送兵员，掩护登6，防备北洋海军。这三句话也是海军的作战顺序，海军前期的主要任务是运送兵员，掩护部队在沿海港口的行动，后期则是防备北洋海军的行动，掌握制海权，保护海上的补给线，如果肯能的话还可以相机行动，力求歼灭或迫降北洋海军。根据分工，萧智将全权负责指挥6海军的行动并组织两者间的协调工作，而6军的具体行动由刘永福指挥，海军的具体行动由林飞负责。为了保障行动的隐蔽和迅，也为了打好北伐的第一丈，萧智等人都同意先攻击临近的广西和云南两地，同时，海军以巡视的名义进入珠江的广州码头，登6舰相机在各处选好的位置登6，广西和云南这几年在安南省的渗透下，很多地方已经被安南省控制了，如果北伐时能快的占领这两个省份，一则可以扩大北伐的影响，显示安南省的实力，二来可以为安南省获得一个缓冲区，减少安南省破坏。
由于各项工作都还处在准备之中，很多工作还比较的麻烦，萧智等人在经过商议后决定，将北伐的开始时间定在1896年5月7号，比原来的计划晚了两个月左右，萧智还命令情报总局严密监视在安南省各国间谍，同时，加紧对本土尤其是长江以南地区的情报收集，密切注意北京方面的情况，为即将到来的北伐做好工作。
1895年的夏天格外的炎热，北京城更是像下了火似的热，但是，在颐和园里却是凉风习习，慈禧现在正倚靠在北海边的凉亭里纳凉，由于名义上已经向光绪帝归还了朝政，所以慈禧也就搬到了颐和园来了。但是，朝中的大臣们都知道，重大的事情还是得慈禧拍板了才算数，所以大臣们在写奏章时都写两份，一份给皇上看，没有什么实质内容，另一份给太后看，这才是货真价实的奏折。对此，光绪皇帝不是不知道，但是却无可奈何，因为慈禧手里掌握着官员的任免大权，而且在宫外，还有荣禄等一班慈禧的心腹掌握着京畿附近的军事大权，虽然现在已经编练了8镇的新军，但是掌握在自己手里只有驻守在山东的一镇，其余的七镇新军皆在太后的掌握之下，现在正在训练的两镇倒是在自己手里，可是才刚刚组建还不堪大用，看来还是得忍耐啊！正在凉亭里纳凉的慈禧此时随手拿起了早上送来的折子，这是四川总督奎俊的奏章，慈禧拿起奏折看了起来，没想到越看越是生气，这脸色也越来越难看了，旁边的李莲英瞧着不对劲，赶紧打岔说道：“太后老佛爷，眼瞅着这太阳快落山了，这湖边的潮气大，奴才恳请太后回宫”，慈禧听了也不以为意，只是“哼”了一声，将奏章一丢，起驾回宫了，李莲英不敢怠慢，捡起慈禧扔在地上的奏章就跟了上去，捡的时候，李莲英偷看了几眼，登时惊出一身的冷汗，奏章上写着《弹劾安南谋逆折》，奏章中大体意思为：臣尊太后谕旨查访安南事宜，近期臣奎俊得到消息，安南省里多有谋逆之言流传于市井，成经多方查证确为属实，安南报纸等多有刊登大逆不道之言论，并有多部在其地广为流传，现将证据呈于太后，臣交旨叩。
这份奏折的分量可是不轻啊！一旦查实，萧智可就是个纵容包辟的大罪，轻则罢官充军，重则抄家杀头，李莲英现在有些为难，说实话萧智对他不薄，每年的孝敬少则十几万，多则五六十万，从没有断过，怎么说这次也得帮帮萧智，可是这是要是太后知道了，那自己就是杀头的大罪啊！难啊！看来得好好想想办法了，这么想着，李莲英跟上了慈禧的车驾。
回到宫里，慈禧就把李鸿章和荣禄等这些自己的心腹叫了来，慈禧现在想听听他们的看法，毕竟萧智等人在安南省经营已久，实力又强悍之极，轻易是动不得的，万一把他逼急了造起反来可就麻烦了，何况萧智等人现在并没有露出反意，最多也就是个包辟纵容乱党，蛊惑人心的罪，但是，慈禧担心啊！她担心萧智万一真和乱党搅在一块怎么办？不过，这次也许是个机会，如果能把萧智从安南那里拿掉，换成自己的人，自己的实力不是就更强了么？这样皇帝那边也就闹腾不起来了。
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