，孔有德等人受毛文龙旧部李九成之子李应元的煽动，在吴桥发动叛变，史称“吴桥兵变”。倒戈杀回山东半岛，连陷临邑、陵县、商河、青城诸城，率兵直趋登州。崇祯五年（1632）一月登州失陷。总兵张可大自杀，孙元化自杀未成，为叛军所擒，后来孔有德等人欲渡海降后金，念孙元化对自己有收留之恩，因此并未加杀害，将孙元化放走。
而在兵变发生之后，朝中多言孙元化已反，因此在崇祯五年三月孙元化、余大成等人被逮至京师镇抚司，为政敌余应桂、李梦辰、路振飞等人所陷害，在狱中曾遭严刑。而当时的首辅周延儒欲免元化死罪，又有徐光启以全家性命担保孙元化无反，但有温体仁为了扳到周延儒，暗中煽风点火，及力诬陷孙元化，因此终于还是无法挽回。于崇祯五年七月二十三日（1632年）孙元化与张焘同被朝廷处死。
孙元化在临死之前，托人转告三子孙和鼎、孙和斗、孙和京，不要因为自己被冤杀而去抱怨朝廷，以后也不要当官，只是要把自己的遗作整理出来，报效国家。果然在孙元化死后，三子把全部精力都投入在整理他的遗作上。他的一些旧部，多次邀请他们出来做官，都被拒绝。
而罗远斌所说的会制做火铳的人，就是孙和鼎。
商毅当然知道，孙元化不仅是明末著名的西洋火炮专家。同时还协助徐光启完成《勾股义》的编写。又独立撰写《泰西算要》、《几何用法》、《几何体论》、《西学杂著》等科学著作。并著有《西法神机》二卷，《经武全书》十卷，介绍西洋铸炮、制火药、筑炮台等方面的军事科技，还提出了许多精辟的用兵之道。可以说是一位十分全面的科学家。
按罗远斌的说法，显然孙元化的几个儿子也受了他的熏陶，精通火器的制做，如果把他们几个人请到穆陵关去，一定可以快速帮自己建立起一支火枪队来。因此商毅才让罗远斌带自己来请孙家兄弟。
听孙和鼎问自己，商毅立刻道：“我听罗远斌说孙先生精通火枪的制造之术，我在穆陵关正好要铸造一批火枪，以抵御关外满清鞑子，因此想聘请先生相助。”
那知孙和鼎听了商毅的来意之后，立刻摇了摇头，道：“先父临终前曾有遗命，令我们兄弟终身不得出仕为官。在下实在不敢有违先父遗命，故此不能从命，还请千总大人见谅。”
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